Phim Nhiệm Vụ Mật dựa trên sự kiện có thật về một nhiệm vụ bí mật tên Operation Anthropoid. Đây là kế hoạch vạch ra nhằm ám sát viên tướng Phát xít Reinhard Heydrich, tư lệnh cao cấp thứ ba dưới quyền Hitler và cũng là nhà lãnh đạo Đức Quốc xã ở Tiệp Khắc.
Theo đó, Jamie Dornan vào vai Jan Kubiš ,một người lính lưu vong của quân đội Tiệp Khắc và một cộng sự của mình là Josef Gabčík (Cillian Murphy) nhảy dù vào quê hương và thực hiện mệnh lệnh giết tướng Reinhard Heydrich với số vũ khí ít ỏi trong tay