Lập Trình Viên Đáng Yêu - Cute Programmer xoay quanh câu chuyện về cô nàng Lục Ly cô đã đem lòng yêu anh chàng nam thần Khương Dật Thành, không chỉ sinh đẹp và tài giỏi, cô còn cố gắng thi vào trường đại học cùng với Thành và cùng khoa công nghệ thông tin, không những thế Lục Ly còn có mong muốn trở thành một lập trình viên. Sau khi tốt nghiệp và chuẩn bị mọi thứ để xin vào công ty của Thành, thế nhưng công ty lại không hề tuyển nhân viên nữ. Vì để có thể tiếp cận Thành gần hơn, Lục Ly đã quyết định cải trang thành nam để được nhận vào công ty, tại đây cô vô cùng nổ lực để có thể thực hiện được những mong ước của mình. Nhưng sau đó xảy ra chuyện ngoài ý muốn khi Lục Ly với Dật Thành đã ký một hợp đồng hôn nhân 1 năm và dần dần tiếp xúc với nhau Thành lại nảy sinh tình cảm với Lục Ly.