Phim Hiệp Án Ký giữa những năm Thiển Khải nhà Minh, gian thần nắm quyền, bá tánh lầm than. Người của Đông Lâm Đảng muốn diệt trừ tội ác của bọn quan lại nên bị họa diệt môn. Trong lúc nguy hiểm, người đày tớ trung thành Mã Sa Kỳ đã đưa cậu chủ nhỏ Cố Nhân Nguyện chạy thoát.

Không ngờ, vì trên người Cố Nhân Nguyện có 1 bí mật kinh thiên động địa nên cả 2 người bị cuốn vào 1 mối nguy cơ lớn hơn. Trên đường đi, gian nan trùng trùng, may nhờ có các nhân sĩ võ lâm trung lương như Dương Đông Tịnh, dì Hoa đứng sau trợ giúp nên 2 người mới thoát khỏi truy sát.

Sát thủ chuyên nghiệp truy sát 2 chủ tớ Diệp Hồng Ảnh bị gian thần từ lâu che mắt nên hết lòng tận trung với triều đình, không phân biệt được chính hay tà và đã giết biết bao người vô tội. Trong quá trình truy sát 2 chủ tớ, Diệp Hồng Ảnh và Mã Sa Kỳ, Cố Nhân Nguyện, Dương Đông Tịnh từ ghét nhau đến hiểu nhau và cuối cùng là nhận ra chân tình, cùng nhau đi con đường chính nghĩa, hoàn thành di nguyện của trung thần – diệt trừ tội ác của bọn quan lại HTV2, VTV1, VTV2, VTV3, VTV9, TodayTV, HTV7, HTV9, HTV3, SCTV4, SCTV9, SCTV16, THVL1, THVL2, BTV, KTV..