Viên Đá Bí Ẩn - Abyss xoay quanh câu chuyện về anh chàng Cha Min một người thừa kế công ty mỹ phẫm giàu có, nhưng anh lại sở hữu một ngoài hình xấu xí và khiến người anh thích là Se Yeon từ chối. Tuy nhiên, một lần anh gặp tai nạn và chết đi, thế nhưng sau đó anh bất ngờ tỉnh dậy và ngoại hình bỗng thanh đổi và trở nên điển trai hơn, không những thế trên tay anh còn cầm một viên đá bí ẩn. Tiếp đến cũng là người anh thích Se Yeon bị giết hại và cũng nhờ viên đá mà cô được hồi sinh với diện mạo khác. Giờ đây, cả hai người cùng nhau hợp tác để có thể tìm hiểu sự thật về viên đá này.