Khi Âm Nhạc Trở Thành Vũ Khí - Takt op.Destiny lấy bối ảnh vào năm 2047, khi Trái Đất lúc này đang phải đối mặt với một cuộc thảm họa đầy nghiêm trọng, một thiên thách đen rơi xuống và sản sinh ra những sinh vật đầy kỳ lạ và chúng được gọi là D2. Chúng có ở khắp mọi nơi và dùng sức mạnh đặc biệt của mình để khống chế ý thức của con người. Lúc này Takt một nhạc trưởng, đã hợp tác với thành viên trong nhóm Musicart là Unmei cùng nhau đánh bại lũ quái vật D2 và đưa thế giới quay trở về cuộc sống trước kia.