Alpha: Người Thủ Lĩnh - Alpha xoay quanh câu chuyện về anh chàng thiếu niên trẻ tuổi Keda đang cùng với những người trong bộ tộc Cro Magnon của mình bắt đầu chuyến đi săn trong vùng hoang dã. Tuy nhiên, cậu lại bị những người này bỏ mặt tại đây cho đến chết, vì thế mà Keda cố gắng tìm cách để có thể sinh tồn. Nhưng, Keda may mắn gặp được một con sói đơn độc đã bị bỏ rơi cả hai đã cùng nhau tạo thành liên minh. Đối mặt với vô số khó khăn thử thách và nguy hiểm cùng nhau vượt qua để có thể quay trở về lại nhà trước khi mùa đông đến.