Tổ chức bóng đêm UNCLE - The Man from UNCLE lấy bối cảnh vào thời điểm chiến tranh lạnh đang nổ ra, những tổ chức tội phạm bí ẩn đang có âm mưu sử dụng những vũ khí hạt nhân và công nghệ hiện đại để có thể phá hủy sự căn bằng của Liên Xô và Hoa Kỳ. Lúc này, Napoleon Solo một đặc vụ CIA cùng với đặc vụ KGB Illya Kuryakin cả hai đều là kẻ thù chung, tuy nhiên buộc phải từ bỏ và cùng nhau hợp tác để ngăn chặn những tên tội phạm xấu xa. Không lâu sau, cả hai cùng nhau giải cứu cô con gái của một nhà khoa học người Đức. Bọn họ phải nhanh chóng tìm được cô ta để ngăn chặn sự diệt vong toàn cầu.