Tín Hiệu Diệt Vong - Project Gemini lấy bối cảnh vào ba năm sau, khi một đại dịch virus đã gần như phá hủy hoàn toàn Trái Đất, và số phận của nhân loại giờ đây đang được các nhà khoa học đang che giấu, và bọn họ còn quyết định thực hiện một kế hoạch tạo dựng cuộc sống mới ngoài vũ trụ. Lúc này 3 phi hành đoàn, là Steve, David và Leona được gia nhập vào nhiệm vụ đến tìm hiểu sự sống trên hành tinh Tess. Thế nhưng, họ không ngờ rằng điều bí ẩn và nguy hiểm đang chờ đợi bọn họ.