Naruto kể về cậu bé Uzumaki Naruto, vào ngày sinh nhật tròn một tuổi của mình, làng lá đã bị tấn công bởi một con cửu vĩ mạnh mẽ. Cha mẹ của cậu vì cứu làng mà phải hy sinh tính mạng của mình họ còn kịp thời phong ấn một nửa cửu vĩ vào bên trong người của cậu. Lúc này, Naruto đã lớn và có mong muốn trở thành ninja mạnh mẽ cũng như chức vị hokage Làng Lá. Nhưng vì có quái vật trong người mà cậu đã bị ngôi làng ghét bỏ. Nhưng chỉ có thầy Umino Iruka là công nhận cậu và cố gắng giúp cậu thực hiện ước mơ của mình. Cũng như có sự giúp đỡ của thầy Kakashi và 2 người đồng đội thân thiết là Sakura và Sasuke. Cả 4 thầy trò bắt đầu cuộc hành trình tập luyện cũng như đánh bại những kẻ thù với âm mưu xấu xa.