Dear. M xoay quanh câu chuyện về cặp đôi thanh mai trúc mã Ma Joo Ah và Cha Min Ho, cả hai đã quen biết nhau hơn 12 năm, nhưng Joo Ah chỉ xem Min Ho là một người bạn thân quan trọng của mình, mặc dù anh luôn dành cho cô tình cảm trên mức tình bạn, nhưng Joo Ah không hề nhận ra được tình cảm ấy. Nhưng một hôm, sự xuất hiện một bài đăng tìm kiếm "M" được người bí đăng trên diễn đàn của trường Seoyeon gây xôn xao học sinh tại đây. Vì tò mò Ma Joo Ah, Cha Min Ho cùng với hai người bạn Seo Ji Min và Park Ha Neul bắt đầu cuộc hành trình tìm kiếm, điều này đã nảy sinh tình bạn và cuộc tình của họ.