Lấy bối cảnh năm 1955, Thuỷ Quái Thiên Trì Núi Trường Bạch xoay quanh đội khảo sát khoa học do Chung Văn Sơn dẫn đầu. Trong chuyến công tác dự báo đầy nguy hiểm, họ đã mất tích ly kỳ vì đi tìm thuỷ quái Thiên Trì núi Trường Bạch, nhiều năm sau Chung Hiểu bất ngờ phát hiện “Thuyết sông ngầm” trong nhật ký của cha. Dưới núi Trường Bạch có một con sông ngầm thông với một khu vực thần bí, cách 24 năm mực nước sẽ hạ xuống, cửa hang dưới nước sẽ hiện ra. Vì vậy, mọi người dựa theo nhật ký của bố Chung, đi qua cửa hang sau màn sương mù đặt chân vào một rừng cây nguyên thuỷ, nơi này không có tín hiệu, từ trường rối loạn, bề ngoài đẹp đẽ nhưng nguy cơ tứ phía.