Truyện đưa ta vào thời kì khi mà Thiên Hoàng Minh Trị vừa tiến hành một loạt cải cách khiến cho một tầng lớp cũ tại Nhật bị xóa bỏ, đó là tầng lớp Samurai. Nhân vật chính của chúng ta là một cựu sát thủ Kenshin Himura, nay đã quy ẩn và trở thành một lãng khách. Trong khi đang lang thang, Kenshin đã gặp và cứu giúp Kaoru Kamiya hiện đang thay cha mình quản lý một võ đường tại Tokyo. Kaoru mời Kenshin đến ở tại võ đường của mình, nhưng cuộc sống của Kenshin không thể bình yên khi mà những kẻ thù từ quá khư liên tục tìm đến anh ta.