Arc 01 02 (01-51): "Là TV Series đầu tiên sau hơn 25 năm kể từ bản gốc. Câu chuyện xoay quanh cuộc Thánh Chiến của Nữ Thần Athena với các thế lực bóng tối vì nền hòa bình của nhân loại. Nhân vật chính trong Omega là Đồng Thánh Pegasus Kouga, đệ tử của Kim thánh huyền thoại Seiya trong phiên bản gốc. Trong phiên bản này, Kouga và các bạn sẽ cùng hợp sức chống lại âm mưu đen tối của Mars - Thần Chiến tranh và giải cứu Nữ thần Athena."

Bắt đầu Arc 03 (52 ). Sau khi trở về từ Hỏa Tinh, các Thánh đấu sĩ của Nữ Thần Athena lần nữa đối đầu với thử thách mới. Lần này là em gái song sinh của Athena, Nữ Thần Báo Thù, Pallas cùng những Pallasite hộ pháp của cô. Sau trận chiến với Mars, thực lực của Thánh Địa đã đại giảm. Nhóm Kouga, Seiya cùng những Đồng-Ngân-Kim Thánh còn sống sót sẽ làm thế nào để ngăn chặn Pallas cùng các Parasite đây?